有關菸害防制法修正案於96年1月16日上午進行二讀程序，第10條及第15條將請王金平院長召集朝野黨團協商獲共識後，再繼續三讀會之程序。衛生署表示：除感謝立法院各位委員的支持，更希望我國能夠及早追趕上愛爾蘭、義大利、瑞典、挪威和香港之立法，讓菸害防制法修正案能早日完成修法。
針對目前我國菸害防制法修正案中待協商的第10條與第15條，衛生署表示：菸品不讓消費者可自行取得之精神，在於增加青少年取得菸品之困難度。而海產店、自助餐店、土雞城、薑母鴨餐廳、羊肉爐餐廳等，依現行法律，已屬於除吸菸室外不得吸菸之場所，如果未設有吸菸室仍不得吸菸，如果非屬室內公共場所，並不會受到規範。
有關媒體報導孕婦和未成年人吸菸之規範，衛生署說明：今日二讀係參照去(95)年11月15日協商結論，因此，孕婦不得吸菸僅係訓示規定，並沒有罰責；而未成年吸菸部分，也只是加強父母、監護人之責任，督促未成人接受戒菸教育，並不會處罰未成年人。至於菸品健康福利捐之課徵係依現行菸酒稅法相關規定，本次菸害防制法修正案僅係法源之移列。