子宮內膜異位症是造成不孕症之原因之ㄧ，但患有子宮內膜異位症並不一定不能自然懷孕。依照美國生殖醫學會分類，子宮內膜異位症分為四期，第一期的極輕微內膜異位不太會影響懷孕功能，而從第二期以後的輕度、中度與重度，都會使自然懷孕的機率降低。
如果經過一段時間的保守治療（如口服排卵藥）仍然無法自然懷孕的話，就需要考慮進一步的手術治療或選擇人工生殖治療。

資料來源：我們好想懷孕（上天最美的禮物）