人類乳突病毒 (HPV) 疫苗接種之不良反應之統計，依據我國食品藥物管理署全國藥品(含疫苗)不良反應通報系統，顯示目前尚未觀察到須採取相關措施之安全疑慮，將持續監測。另，截至2023年5月底，接種約61.7萬劑，共接獲通報491件不良反應（約千分之0.8），最常出現的症狀為發燒，其次是注射部位紅腫、噁心嘔吐及頭痛，多屬輕微至中等程度且為時短暫。
資料來源：國民健康署癌症防治組