為持續提昇全國性新生兒篩檢工作品質，目前由臺灣大學醫學院附設醫院、中華民國衛生保健基金會附設醫事檢驗所及台北病理中心3家篩檢中心辦理「新生兒先天性代謝異常疾病篩檢合約實驗室」計畫工作。提供各採集機構所送新生兒篩檢血片之初篩、複檢及個案追蹤等服務；各合約實驗室之主要負責區域，如后：

    （一）臺灣大學醫學院附設醫院：新北市、新竹市、新竹縣、雲林縣、高雄市、台東縣、花蓮縣、金門縣等縣市以及臺灣大學醫學院附設醫院。
    （二）中華民國衛生保健基金會附設醫事檢驗所：臺中市、彰化縣、南投縣、嘉義縣、臺南市、屏東縣等。
    （三）台北病理中心：宜蘭縣、基隆市、臺北市(不含臺灣大學醫學院附設醫院)、桃園市、苗栗縣、嘉義市、澎湖縣、連江縣等縣市。為確保新生兒篩檢之採集作業時效及相關服務品質，若針對新 生兒篩檢採集執行注意事項有相關疑義者，可逕洽本署合約之實驗室（台灣大學醫學院附設醫院：02-23123456轉71930，中華民國衛生保健基金會附設醫事檢驗所：02-87681020轉11，台北病理中心：02-85962065轉401）或本署婦幼組王小姐（聯絡電話：04-22172421，E-MAIL：shu@hpa.gov.tw）。